環保署表示，該署3月12日預告的「禁止在飲用水水源水質保護區或飲用水取水口一定距離內之地區，開發客房數達20間以上旅館（飯店、賓館）、觀光旅館、休閒農場或客房數達16間以上民宿之行為」，是基於法律規範明確的原則，將行之多年的行政解釋，以法規命令的方式公告，管制方式前後一致，並未放寬。
台灣水資源保育聯盟3月27日表示：環保署預告的「禁止在飲用水水源水質保護區或飲用水取水口一定距離內之地區，開發客房數達20間以上旅館（飯店、賓館）、觀光旅館、休閒農場或客房數達16間以上民宿之行為」將鼓勵旅館民宿開發，所以反對修法。環保署針對該聯盟的意見特予說明。
環保署說，由於本次預告內容與過去管制方式一致，沒有放寬，所以沒有鼓勵旅館民宿開發的疑慮。該署進一步說明如下：
一、依飲用水管理條例第5條規定：「在飲用水水源水質保護區或飲用水取水口一定距離內之地區，不得有污染水源水質之行為。」條文中並明定污染水源水質的行為態樣，且授權中央主管機關公告禁止行為。
二、飲用水管理條例中已明定禁止20戶以上「新社區」的開發，至於開發規模20間以上「旅館、觀光旅館、休閒農場、民宿」開發行為，由於其土地利用型態屬社區型態，有住宿及產生廢水事實，因此也屬污染水源水質行為，依該署歷年行政解釋，多年來都是禁止的行為。
三、本次預告，是基於「新社區」與「旅館（飯店、賓館）、觀光旅館、休閒農場或民宿」的開發行為，性質及內容仍有不同，為使法律規範內容更加明確，不致混淆，所以依飲用水管理條例的授權，將「旅館（飯店、賓館）、觀光旅館、休閒農場或民宿」的開發管制，以法規命令的方式獨立公告，不再併入「社區」中規範，以利各界遵行，管制方式前後一致，沒有放寬。
環保署再次重申，本次預告是基於法律規範明確的原則，將行之多年的行政解釋，以法規命令的方式公告，管制方式沒有放寬，後續一旦順利公告，原來的行政解釋，將配合一併停止適用，以完備法制作業。
