環保單位依據衛生署「登革熱防治工作指引」， 以「清除孳生源為主， 緊急噴藥為輔」登革熱防治原則， 協助衛生機關辦理病媒蚊孳生源清除及噴藥工作， 統計101年1月至8月全國環保機關登革熱防治工作成果， 共動員病媒蚊孳生源清除約83萬人次， 清除容器約530萬個， 空地清理2萬餘處， 廢輪胎清理約6萬900個， 告發件數為2,535件。另為及早因應今年疫情， 結合村里、志義工與環保衛生機關的力量， 於4月23日至6月29日針對全國22縣市辦理登革熱病媒蚊孳生源三級複式動員檢查評比， 透過村里互檢、地方環保衛生機關複查及中央環保衛生機關追蹤複查等逐級查核方式， 加入衛生署疾管局「容器減量」觀念， 共同防治登革熱。
環保署表示， 為因應入夏高溫持續降雨及颱風季節， 督促地方政府7月及8月持續辦理登革熱孳生源二級複式動員檢查， 並針對100年及101年本土登革熱疫情較為嚴重之10個重點縣市（臺北市、新北市、臺中市、臺南市、高雄市、宜蘭縣、苗栗縣、嘉義縣、屏東縣及澎湖縣）於9月至12月持續加強辦理登革熱孳生源二級複式動員檢查， 以強化落實孳生源清除成效。地方環保機關亦加強輔導及勤查， 對於有違反公共環境衛生者， 依「廢棄物清理法」相關規定予以處分， 目前臺南市政府環保局及高雄市政府環保局已分別依法開立152件及26件處分， 民眾若發現有病媒蚊孳生源， 可撥打全國免付費的公害陳情專線0800-066666檢舉， 環保機關會儘速予以查處。
