環保機關依據衛生福利部「登革熱防治工作指引」， 以「清除孳生源為主， 緊急噴藥為輔」防治原則， 協助衛生機關辦理病媒蚊孳生源清除及噴藥工作。統計103年1月至7月地方環保局孳生源清除動員75萬餘人次， 清除容器247萬餘個， 廢輪胎4萬9千餘個， 清理空地2萬5千餘處， 告發577件。為因應本年度登革熱疫情， 環保署自4月至6月推動全國登革熱孳生源複式動員檢查， 透過村里長及志義工的協助， 發送宣傳單及檢查表， 並進行村里互檢及地方環保局複查， 並自7月至12月持續推動各地方環保局加強辦理複式動員檢查及清除， 協助民眾清理居家戶外積水容器。
登革熱病媒蚊在積水處產卵， 約1週後就能羽化為登革熱病毒傳播媒介。環保署不預警派員到登革熱疫情較嚴峻的地區協助辦理戶外孳生源巡檢， 發現常見的戶外孳生源包括廢輪胎、帆布、水桶、花盆容器等， 也立即將缺失函送提供環保局改善。為防堵登革熱疫情， 請民眾務必發揮主動清理的利人利己精神， 每週至少執行一次家戶內外孳生源檢查， 清除積水器物、巡檢居家戶內外周圍及屋頂等容易忽略的角落， 如花瓶、盛水盤、廢水桶、廢保利龍、廢寶特瓶、廢棄鍋碗、水缸、盆栽墊盤、塑膠帆布及廢輪胎等容易積水器物， 徹底做到「巡、倒、清、刷」：仔細「巡視」家戶內外積水容器， 將積水「倒掉」， 不要的器物予以分類「清除」， 減少容器， 留下的器物也要「刷洗」去除斑蚊蟲卵， 妥善收拾或予以倒置。
對於戶外難以清理的登革熱病媒蚊孳生源， 建議可撥打環保報案電話專線0800-066-666向所在地環保局通報或檢舉， 方便上網的民眾則可透過環保署建立的「清淨家園顧厝邊綠色生活網(EcoLife)」（http://ecolife.epa.gov.tw/， 簡稱綠網）通報登革熱孳生源， 或於綠網下載髒亂剋星APP以手機方式通報， 政府將派員儘速清除。地方環保機關亦會加強輔導及勤查， 對於戶外未落實清除孳生源者， 將依「廢棄物清理法」相關規定予以處分。並請民眾加強個人保護措施以避免被蚊蟲叮咬， 如有發燒、頭痛、關節痛、肌肉痛等典型登革熱症狀， 請儘速就醫。做好自我健康管理， 避免被病媒蚊叮咬， 徹底清除孳生源， 才能有效控制登革熱疫情。
