柯子湖人工濕地位於頭前溪湳雅取水口上游， 經國大橋及高速公路橋中間河川高灘地， 占地面積8公頃。主要處理柯子湖排水系統之生活污水及農業排水， 處理水量為每月8,000公噸， 每日可削減生化需氧量(BOD) 9.6公斤、懸浮固體(SS) 80公斤及氨氮(NH3-N) 8公斤， 並緩衝、攔截、去除柯子湖排水造成取水口上游之污染， 而溪埔子人工濕地位於溪州大橋下游河川高灘地， 占地面積12公頃。處理新竹市北區及東區1/3區域由溪埔子排水匯入頭前溪之污水， 改善頭前溪中、下游段之水質， 本工程每日處理污染排水量為16,000公噸， 每日可削減生化需氧量(BOD) 43公斤、懸浮固體(SS) 200公斤及氨氮(NH3-N) 24公斤。二工程103年底可以完成， 本署合計補助5,332萬元。
環保署表示2處人工濕地完成後，除了可控制頭前溪水源水體水質外，可維持河川基流量與潔淨水岸環境、生態河廊環境，提供當地居民及遊客休閒場所與環境教育使用。
